核心种质反映了种质资源的多样性，使遗传资源评价更加有效。为提高青藏高原地区青稞种质资源的管理水平，麦类作物分子育种学科组基于204份（39份育成品种和165份地方品种）广泛分布青藏高原的青稞，利用均匀覆盖大麦7条染色体的1750个SNP标记，确定了20%的抽样比例（即41份青稞）构建核心种质。采用5种不同的方法（Mstrat、Random、REMC、SBS和SFS）构建了5个不同的核心种质库。通过对其代表性进行评价和分析，最终确定由Mstrat方法构建的核心种质库（由11份育成品种和30份青稞地方品种组成）在遗传结构和多样性方面均具有较好的代表性。最后，筛选出分布在7条染色体上的28个SNP可以区分204份青稞的遗传关系，可为青稞品种进行鉴定和品种纯度检测提供分子证据。总之，核心种质的构建有利于种质资源的长期保存，也可以为青稞的遗传改良提供有效支持。